Carlos tradujo una nota muy interesante en la que un consultor para IBM compara 2 de los más importantes CMS del momento como Drupal y Joomla. En la misma se pone a discusión puntos como rendimiento, curva de aprendizaje, flexibilidad plantillas, programación, etc.
Si bien no comparto en un 100% los puntos negativos que adjudica a Joomla, es un buen resumen el que hace al final donde recomienda:

Usa Joomla si quieres tener un sitio bonito de forma rápida y puedes afrontar tener un sistema más lento, una categorización de contenido rígida y unas opciones de configuración y de diseño limitadas.
Usa Drupal si quieres alto rendimiento, escalabilidad, buen gestor de contenido y una flexibilidad de diseño significativa. Pero prepárate para gastar un montón de dinero/tiempo en conseguir un sitio profesional.

Via | Carlos Rincon - Código Geek